在小龙虾病害防治方面，通常采用“先杀虫、后消毒，无病则防、有病则治”的方法。但在夏季高温情况下，这种方法不实用，因为在夏季持续高温的情况下，养殖水体的分层现象特别严重，水体上下层对流停止，下层水体处于缺氧状态，并且杀虫药物和消毒药物都会杀死水体中的浮游生物，溶解氧含量下降，造成缺氧泛塘，或者亚硝酸盐、氨态氮含量上升，使小龙虾不摄食，呈中毒状或鱼病爆发。解决办法通常用环保型底质水质改良药物和增氧剂来调节水质。一般白天加开增氧机，并进行加水换水，配以内服药物，不能大面积用药，以防造成水质突变，加重病害。在投饵时，用药物泼洒在饲料台附近，形成“药浴”环境，采用以内服为主，日常消毒为辅，结合换水的治疗方法，使用的药物一般用比较温性的二氧化氯、二溴海因、聚维铜碘等。